câu chuyện của một ngàn năm kể từ khi Gauna, một chủng tộc người ngoài hành tinh lạ không có phương pháp được biết đến thông tin liên lạc, phá hủy các hệ thống năng lượng mặt trời. Một phần của nhân loại được quản lý để thoát khỏi bằng cách sử dụng “tàu hạt giống” rất lớn như Sidonia, mà đã cho phép họ duy trì dân, vừa trôi qua không gian.
Kể về diễn biến tiếp theo sau phần 2 serries Anime cùng tên, chủ yếu là về trận chiến cuối cùng tại Sekigahara để quyết định người dành quyền thống nhất Nhật Bản
Nobita tìm thấy một vật hình tròn màu xanh bí ẩn và một cái chân người máy khổng lồ ở phía Bắc ngôi nhà. Nobita mang cả 2 thứ đó về nhà thì bỗng dưng những phần còn lại của người máy, từng phần từng phần một liên tục rơi xuống sân nhà cậu.
Chín người bình thường trên khắp thế giới bị bắt cóc và biến thành những cyborg có sức mạnh khủng khiếp nhằm mục đích phục vụ chiến tranh. Chín người này đã đứng lên chống lại người tạo ra mình để giành lại công lý và hòa mình cho thế giới nhưng họ đang sống trong một thế giới mà công lý
I kind of understand now... Youre afraid of losing things, right? The season turns to autumn. The fight of the protagonist and his group S.E.E.S. with the strange monsters called ‘Shadows’ is getting closer to the end. Makoto and his allies engage in life-or-death battles with Shadows in order to end the Dark Hour.