Tiếp theo phần 1. Có điều phần 2 này hơi bị romance đấy. Phần 2 này nổi bật lên cặp Chizuru và Masaki gây nên nhiều pha cảm động. Còn có 1 tình cảm nhẹ nhàng của chàng Yuki. Còn mối tình nào nữa không thì quên rùi. Và cuối cùng là cả đám tốt nghiệp
Một cô bé học sinh tiểu học tên là Ichijou Hotaru cùng bố mẹ chuyển về 1 vùng quê xa xôi, Từ đây cô bé phải tập làm quen với trường mới và bạn mới, bé lớn nhất mới học lớp 8.
Kể về mấy con rối biết chạy, nhảy, đánh nhau, tung tuyệt chiêu… Chuyện kể về cô bé Misaki và các trận chiến Angelic Layer. Qua mỗi trận đấu cô bé lại trưởng thành hơn và cũng tiến gần hơn đến trận chiến với… chính mẹ của mình.
Yuuki có một kí ức từ rất sớm về một buổi tối mùa đông bão tuyết khi đó cô đang bị một vampire* tấn công sau đó lại được một vampire khác cứu.
2 chàng trai, chưa từng gặp nhau trước đó: Tsukushi Tsukamoto, không hề có kỹ năng đặc biệt nào cả, nhưng lại có trái tim đam mê cuồng nhiệt và Jin Kazama, một thiên tài bóng đá, cũng chính vì thiên tài nên luôn bị cô lập.