Thời đại Liên Minh là câu chuyện kể về cuộc sống của những sinh viên nhàn rỗi của trường đại học Đông Hoa (Thượng Hải) hằng ngày ngày chỉ biết cắm mặt vào game và tiêu điểm của bộ phim là cậu sinh viên bình thường toàn diện có tên là Miêu Chí Cường.
Câu chuyện đặt bối cảnh tại Onomichi, Hiroshima năm 20XX, khi mà cá voi là loài cá duy nhất còn sống trên biển. Vì thế, bộ Thủy sản quyết đinh xây những bể cá khổng lồ trong không gian. Liên minh thủy sản vũ trụ Onomichi được thành lập để đào tạo ngư dân không gian.
Giờ là năm 2577, con tàu có người lái đầu tiên đã đáp xuống Sao Hỏa với 6 phi hành gia được đưa đến để làm nhiệm vụ. Nhưng tất cả những gì họ thấy được là Những con Gián đột biến hình người với sức mạnh kinh hồn. Họ đã bị giết sạch, tuy nhiên, họ đã gửi được tín hiệu về Trái Đất. Giờ đây, con người đã đưa các chiến binh ưu tú nhất để diệt gọn đám bọ đột biến và giành lại Sao Hỏa.
Thời đại Văn minh đã chết, nhưng Chito và Yuuri vẫn còn sống. Vì vậy, họ ở trên chiếc xe máy Kettenkrad yêu dấu của họ và đi lang thang trên những tàn tích của thế giới mà họ từng biết. Ngày sau ngày tuyệt vọng, họ tìm kiếm bữa ăn và nhiên liệu tiếp theo cho chuyến đi của họ
Trong thời kỳ phong kiến của Nhật Bản, có một cuộc chiến giữa hai gia tộc ninja: Byakuro và Kabusu. Một đêm, Kabusu tổ chức một cuộc tấn công dữ dội vào lâu đài Byakuro với hy vọng bắt cóc công chúa trẻ sơ sinh của gia tộc.