Cốt truyện xảy ra vào 10 năm sau của Yu-Gi-Oh phần đầu. Lúc này Yugi Muto đã trở thành một tượng đài bất diệt trong làng bài ma thuật. Nhân vật chính của series là Yuki Judai, một thiếu niên đam mê bài ma thuật quyết tâm trở thành Vua đấu bài. Cậu tham dự kỳ thi tuyển vào học viện đào tạo bài thủ Duel Academy và được xếp vào nhà Osiris Red.
vẫn sẽ là trận chiến của cậu bé mồ côi tên Seiya, khi cậu phát hiện ra thân phận thật sự của mình là một Thánh Sĩ có nhiệm vụ bảo vệ cho sự hồi sinh của Athena, nữ thần của trí tuệ và chiến tranh.
Chỉ cần giữ trong tay Cuốn sách Đỏ và hô to thần chú, 1 luồng sét sẽ phóng ra bất kỳ lúc nào. Từ khi cậu bé Gash kỳ lạ xuất hiện, cuộc sống của 1 thiên tài khi mới chỉ là học sinh trung học, Kyomaro, đã thay đổi lớn. 1 cuộc chiến để chọn ra 1 vị vua cho Thế Giới Yêu Tinh giữa 100 Yêu Tinh (demon). Số phận của Kyomaro và Gash Bell sẽ ra sao? 1 cuộc chiến thực sự căng thẳng đã bắt đầu! Trong cuộc chiến để dành được vị trí cao nhất, Gash Bell và Kyomaro đã phải trải qua rất nhiều khó khăn và cũng
Năm 4699, những con tàu trôi dạt trong không gian được gọi là cá voi. Công Ty Săn Bắt Cá Voi Ahab là công ty được dẫn dắt bởi thợ săn cá voi nổi tiếng Ahab. Một hôm, có một đứa trẻ tên Lucky đến gặp Ahab, nhờ ông ấy giải cứu Mohd, hành tinh quê hương của cậu đang gặp nguy hiểm.
Thời Đại Thần Thánh đã đến hồi kết thúc. Sự bất tử cũng sẽ không còn.Cõi Thiên Đàng rung chuyển khi đội quân của Falis, Thần Ánh Sáng...... Chạm trán với quân của Falaris, Thần Bóng Tối.Trong trận chiến không ngừng nghỉ sau đó,Trái Đất bật khóc...Biển cả sôi sục...Cuối cùng, chỉ có hai người sống sót của mỗi bên